中国医药集团重庆医药设计院(英文缩写CPIDI)是原国家医药管理局直属甲级设计院，具有四十多年设计历史，2000年加入中国医药集团。执有化工石化医药行业工程设计、建筑行业工程设计、工程总承包、工程咨询、特种设备设计许可证（压力容器、压力管道）、建设工程防火设计、建筑智能化系统工程设计等甲级资质证书，同时拥有市政公用、电子通信、环境影响评价、安全评价等相关行业乙级资质证书，并取得中华人民共和国对外承包工程经营资格证书。  
       重庆医药设计院主要承担国内外医药、农药、兽药、化工、精细化工、石油化工、食品工业、市政公用、电子工程、日用化工、工业与民用建筑、医疗建筑、公共建筑、科研建筑等工程设计，是一个以设计为龙头，同时开展工程咨询、工程承包、项目管理、环境影响评价、安全评价等业务，为业主提供全过程技术服务的综合性设计院。 
       重庆医药设计院组织机构健全，是国内最早一批通过ISO9001质量管理体系认证的设计单位；专业结构合理、配套齐全，设有工艺、设备、建筑、结构、及公用工程等建设领域所需的各个专业；技术力量雄厚，人力资源充足，拥有多名享受国家政府津贴的著名专家，各类注册工程师90余人次，中、高级技术人员占全员80%以上，本科学历以上人员占全员90%以上；技术装备(软、硬件)水平处于国内医药行业专业设计院前列，实现了工程计算电算化、工程设计绘图 CAD化、经营管理信息化、档案管理电子化。近年来获、省部级优秀设计奖、优秀软件奖和技术进步奖三十多项，编制、参与编制、评审国家、地方及行业规范十余项，具有全面的制药工程技术，是药品生产GMP技术、净化技术运用方面的权威单位之一。 
       历年来，重庆院完成各类工程项目1000多项，遍布各省、市、自治区及香港特别行政区、澳门特别行政区，承担了国内大量的重点医药工程设计任务，高水平的设计和高质量的服务享誉医药工程建设领域，并与国内诸多大型制药企业建立了长期合作联系。同时，注重与国际上同行、厂商和工程公司进行交流与合作，积累了较为丰富的对外合作的经验。