广西大藤峡水利枢纽开发有限责任公司作为大藤峡水利枢纽工程的建设单位，于2009年8月由国家水利部、广西壮族自治区政府及广东省政府按照“政府主导、财政补贴、市场运作、流域与区域共赢”的原则，共同投资组建的大型国有企业。公司由五家股东构成，分别为广州华南水资源投资有限公司出资股比为46%，广西投资集团有限公司出资股比为34%，广西水利电业集团有限公司出资股比为10%，广东水电二局股份有限公司出资股比为7%，广东省水利电力勘测设计研究院出资股比为3%。公司注册所在地在广西南宁市，注册资本5亿元。
　　目前公司组织架构已基本建立，现阶段下设综合部(董事办)、总工办（工程技术部）、财务部、计划合同部、工程建设部、资产管理与设备材料部、环境移民部、安全生产监督部、监察审计部（监事会工作部）等九个部门。